Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vps8Q0P5W1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms