Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf541Q0GGX2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms