Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms