Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cxcr5Q04683 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cxcr5Q04683 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cxcr5Q04683 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cxcr5Q04683 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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