Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PgrQ00175 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms