Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Npas1P97459 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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