Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Taf1bP97358 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Taf1bP97358 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Taf1bP97358 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Taf1bP97358 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Taf1bP97358 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Taf1bP97358 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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