Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl21cP86793 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl21cP86793 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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