Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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