Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Usp9xP70398 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9xP70398 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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