Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms