Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms