Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vsnl1P62761 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vsnl1P62761 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms