Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp25P57080 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp25P57080 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms