Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Cldn18P56857 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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