Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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