Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psen1P49769 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psen1P49769 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psen1P49769 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms