Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax7P47239 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pax7P47239 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pax7P47239 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pax7P47239 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms