Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NodalP43021 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NodalP43021 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms