Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk2P38575 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms