Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc5P32043 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms