Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RxrgP28705 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RxrgP28705 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxrgP28705 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms