Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa2P28309 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms