Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Xrcc5P27641 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc5P27641 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Xrcc5P27641 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Xrcc5P27641 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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