Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd12P23812 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms