Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnnc1P19123 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnnc1P19123 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms