Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms