Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irf1P15314 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irf1P15314 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Irf1P15314 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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