Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms