Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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