Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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