Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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