Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ldb2O55203 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ldb2O55203 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ldb2O55203 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb2O55203 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms