Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
DffaO54786 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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DffaO54786 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DffaO54786 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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