Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Clk2O35491 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clk2O35491 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Clk2O35491 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Clk2O35491 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Clk2O35491 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Clk2O35491 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Clk2O35491 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Clk2O35491 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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