Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atf6bO35451 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atf6bO35451 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atf6bO35451 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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