Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Degs1O09005 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Degs1O09005 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Degs1O09005 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Degs1O09005 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Degs1O09005 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Degs1O09005 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Degs1O09005 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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