Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms