Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp35M0QWN7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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