Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms