Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms