Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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