Protein–RNA interactions for Protein: J3KMT3

Gm6882, Predicted gene 6882, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6882J3KMT3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6882J3KMT3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.6 ms