Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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