Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20696H3BJN7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20696H3BJN7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20696H3BJN7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm20696H3BJN7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20696H3BJN7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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