Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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