Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms