Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8005F6YKY3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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