Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm10378F6XQQ1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm10378F6XQQ1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms