Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms